의정부과학도서관은 연면적 6,951.7㎡으로 지하 1층에서 지상 3층의 규모로 이루어져 있다. 지하 1층은 회원가입 및 상호대차도서 등을 수령할 수 있는 통합데스크와 독서 및 휴식을 함께 할 수 있는 북카페, 공연 및 강연 등이 가능한 아트홀이 있다.
또한 1층은 어린이청소년자료실, 정기간행물코너, PC 코너가 있으며, 2층은 일반자료실, 노트북 코너, 3층은 어린이과학체험실, 배움터, 독서토론실 등으로 구성되어 있다.